Distribución genómica de microsatélites en moluscos

  1. CRUZ RODRÍGUEZ, FERNANDO
Dirixida por:
  1. Pablo Presa Martínez Director

Universidade de defensa: Universidade de Vigo

Fecha de defensa: 27 de maio de 2005

Tribunal:
  1. Gonzalo Álvarez Jurado Presidente/a
  2. Paulino Martínez Portela Secretario/a
  3. David Skibinski Vogal
  4. Antonio Figueras Huerta Vogal
  5. Paulo Alexandrino Vogal
Departamento:
  1. Bioquímica, xenética e inmunoloxía

Tipo: Tese

Teseo: 128714 DIALNET

Resumo

Seiscientas treinta y cinco secuencias de ADN procedentes de 35 especies de molusco s, se usaron como soporte taxonómico para investigar los patrones de distribución de polimononucleótidos (poli-(A/T) y poli-(G/C)) en regiones genómicas de distinta funcionalidad. Este estudio muestra que la distribución de los dos tipos de polimononucleótidos no se ajusta a lo esperado por azar en regiones no codificantes (intrones-UTR y ADN intergénico), mientras que sí lo hace en exones. Este hecho se explica por las restricciones selectivas que limitan la expansión y contracción de las repeticiones situadas en regiones codificantes. La distribución de las clases de tamaño del tándem se ajusta a una exponencial decreciente, a medida que aumenta el número de repeticiones. Este hecho permite descartar la existencia de un tamaño umbral para el patinazo de replicación, concepto muy extendido en los modelos de mutación, y apoya el comportamiento probabilístico del mismo. La densidad de repeticiones poli-(AlT) no está correlacionada con la cantidad de ADN de las especies estudiadas y podría estar más relacionada con la tasa de mutación de cada genoma y con su contenido A/T. El conocimiento de la distribución de microsatélites de motivos superiores a 1 pb en eucariotas, es fundamental para clarificar la abundancia diferencial de microsatélites bajo una perspectiva evolutiva. Utilizando datos de 3.165 secuencias de ADN de 326 especies de bivalvos, se han estudiado los patrones de distribución de microsatélites en distintas regiones genómicas. Algunos motivos microsatélites de bivalvos muestran las densidades genómicas más bajas observadas en eucariotas, lo cual podría estar relacionado con el exceso de polimononucleótidos observado en algunas especies. Se enuncia la paradoja de los microsatélites según la cual, especies cercanas con un tamaño del genoma similar, muestran diferencias notables de riqueza en microsatélites. Lo